台湾清华大学内创立的“清华海峡磋商院”，被台安一切门质疑遭到大陆所谓“浸透”，台教训事件主管部分、经济事件主管部分与台湾方面会构成所谓“项目幼组”，赶赴台湾清华大学等举办所谓彻查，并得出违反所谓“两岸相合条例”的结论。岛内舆情一片哗然，纷纷挑剔“用政事力涉入、伤害学术界，危害两岸学术互换”。国台办此前也曾回应指出，这是政府阻截限度两岸寻常互换团结的又一恶例，这种倒行逆施不得人心。
归纳台媒报道，清华大学校友会与厦门市当局、北京清华大学正在新竹的台湾清华大学校内共设“清华海峡磋商院”从事本领研发、揽才、投资，却遭政府质疑违反所谓“两岸相合条例”，台湾教训事件主管部分已央浼该办公室速即休止运作，并将依法开罚新台币50万元。同时，该部分9日发函全台各大专校院，称两岸教训互换主意是激动互相通晓与疏通，应本着“平等互惠”准则，依照所谓“相干律例”。
中国民代郑正钤上周正在台立法机构质询台行政机构肩负人时提到，清华大学的创造源自于美国退还的庚子赔款，经管赔款的是中华教训文明基金会威尼斯9499登录入口，至今台湾清华大学每年还收到庚子赔款支票，而和台教训事件主管部分肩负人潘文忠公然都不清楚。
郑正钤15日默示，正在执政下威尼斯9499登录入口，这些史籍的借镜，正在位者公然绝不汗颜地说“不清楚”，是赤裸裸地向国民显现执政者的愚昧。
台大校长管中闵受访时默示，他要指示那些有权利或提议侦察台湾清华大学这件事的人，两岸的学术互换或团结，过去是被饱动的，不行由于现正在不热爱，就反过来说十几年前是错的。
国台办措辞人朱凤莲正在10日举办的音信揭橥会上对此默示，政府惯于以各类饰词为两岸同胞互换团结创立困苦，延续地举办作梗危害。这是政府阻截限度两岸寻常互换团结的又一恶例威尼斯9499登录入口，这种倒行逆施是不得人心的。（中国台湾网张玲）